FANIN Nicolas

INRAE Centre de Bordeaux Aquitaine 71 avenue E. Bourlaux CS 20032 33882 Villenave d'Ornon cedex Tél : 05 57 12 25 16

nicolas.fanin@inrae.fr

Parcours

•2017-Présent: Chargé de Recherche CR2, Département EFPA –Ecologie des forêts, prairies et milieux aquatiques.

•2015-2016: Post-Doctorat, Department of Forest Ecology and Management, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Umeå-Suède. Rôle de la biodiversité sur les relations sol-plante et la multifonctionnalité des écosystèmes le long d’un gradient d’îles boréales.

•2013-2014: Post-Doctorat, Fractionnement AgroRessources et Environnement (FARE), INRA, Reims-France. Rôle fonctionnel des communautés du sol lors de la minéralisation du carbone, de l’azote et du phosphore le long d’un gradient d’usage des terres.

•2009-2012: Thèse de Doctorat, ‘Spécialité science du sol et fonctionnement des ecosystèmes’. Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), CNRS, Montpellier-France. Médaille d’argent de l’Académie d’Agriculture 2014. Influence de la qualité de la litière sur le fonctionnement microbien en forêt tropicale de Guyane française.

Recherches et compétences

Mes intérêts de recherche portent sur les mécanismes biochimiques à petite échelle qui donnent lieu à des conséquences sur le fonctionnement des écosystèmes à grande échelle.

Je suis particulièrement intéressé par le rôle de la biodiversité, de l’habitat et des changements climatiques sur les communautés microbiennes (champignons/bactéries), et en retour, sur la multifonctionnalité des écosystèmes terrestres et les principaux cycles biogéochimiques du carbone (C), de l’azote (N) et du phosphore (P). L’enjeu principal de mes travaux de recherche est d’identifier les mécanismes par lesquels la perte de biodiversité et les fluctuations du climat affecte la stabilité des fonctions du sol, et ainsi la fourniture de biens et services écosystémiques essentiels au bien-être humain. Ma recherche recoupe les domaines de l’écologie fonctionnelle, la chimie, l'écologie des communautés et l’écologie microbienne.

Projets en cours

• Programme de recherche (2018-2022) 

Fonctionnalité des communautés de décomposeurs du sol : Conséquences pour les couplages des cycles carbone-azote-phosphore lors de la minéralisation de la matière organique et du recyclage des nutriments.

•Projet VR (Swedish Research Council) - Context-dependency of biodiversity effects.

En partenariat avec l’Université d’agriculture Suédoise à Uppsala et Umea et du CSIRO à Glen Osmond en Australie, j’aborde la question de savoir comment le contexte environnemental influence les effets de la biodiversité sur les processus écosystémiques. Pour ce faire nous utilisons un gradient de 30 îles (chacune étant un écosystème indépendant), représentent collectivement une chronoséquence d’îles boréales de plus de 5000 ans. Différentes espèces (myrtille, airelle…) et groupes fonctionnels de plantes (mousse, arbre, buisson…) ont été supprimés pendant plus de 20 ans afin de simuler une perte de biodiversité dans chacune de ces îles. L’objectif est d’identifier les mécanismes par lesquels la diversité des plantes influence la diversité du sol, et en retour, comprendre comment la perte de biodiversité influence la multifonctionnalité dans des écosystèmes contrastés.

•Projet Dipticc (Agence Nationale de la Recherche) - DIversité et Productivité des forêTs impactées par le Changement Climatique

En partenariat avec Bordeaux Science Agro, BIOGECO (Bordeaux), l’EEF (Nancy) et le CEFE (Montpellier), l’objectif de ce projet est d’évaluer si la biodiversité des écosystèmes forestiers permet d’atténuer l’effet des changements climatiques. Pour ce faire, nous utilisons deux dispositifs: le dispositif ORPHEE dans lequel plus de 25000 arbres de 5 espèces locales ont été plantés dans toutes les conditions possibles ; le dispositif BIOPROFOR qui se compose de six sites naturels dans les Alpes dans lesquels les espèces sont étudiées à différents niveau d'élévation. L’objectif principal du projet est de tester si des peuplements plurispécifiques sont plus stables (résistant/résilient) face à la sécheresse que des peuplements monospécifiques. Plus particulièrement, nous étudions le fonctionnement du sol au travers des racines et champignons mycorhiziens et leurs impacts sur la disponibilité des nutriments au sein des écosystèmes forestiers.

•Projet TeaTime4Science (http://www.teatime4science.org/) - Can drinking tea help us understand climate change?

L’objectif de ce projet participatif à large échelle et d’enterrer des sachets de thé vert et rouge, et de les récupérer trois mois plus tard afin mesurer les taux de décomposition. En partenariat avec l’ONF et le réseau RENECOFOR, plus de 1200 sachets de thé ont été disposés dans plus de 100 sites forestiers en France. Les résultats en lien aux données pédologiques des sols permettront de comprendre quels sont les principaux facteurs influençant le processus de décomposition. De plus, ces données rentreront dans une base de données mondiale permettant de mieux appréhender le rôle du climat lors du de la dégradation des matières organiques.

Enseignement et activités scientifiques

• Bordeaux Sciences Agro: Science du sol, écologie microbienne. 
• Université de Bordeaux (Master): Ecologie fonctionnelle, écologie du sol, écologie forestière.
• Reviewer > 15 journals, associate editor in Frontiers in Forests & Global Change, section  Forest soils.

Publications

Publications récentes depuis 2018

Bon, L., Augusto, L., Gaudry, J., Bakker, M. R., Lambrot, C., Milin, S., ... & Fanin, N. (2023). Effects of fertilisation and understory removal on aboveground and belowground carbon stocks in wet and dry moorlands in south-western France. European Journal of Forest Research, 1-15.

Maxwell, T. L., Augusto, L., Tian, Y., Wanek, W., & Fanin, N. (2023). Water availability is a stronger driver of soil microbial processing of organic nitrogen than tree species composition. European Journal of Soil Science, 74(1), e13350.

Fanin, N., Clemmensen, K. E., Lindahl, B. D., Farrell, M., Nilsson, M. C., Gundale, M. J., ... & Wardle, D. A. (2022). Ericoid shrubs shape fungal communities and suppress organic matter decomposition in boreal forests. New Phytologist, 236(2), 684-697.

Maillard, F., Jusino, M. A., Andrews, E., Moran, M., Vaziri, G. J., Banik, M. T., Fanin, N., ... & Schilling, J. S. (2022). Wood-decay type and fungal guild dominance across a North American log transplant experiment. Fungal Ecology, 59, 101151.

Lin, J., Lin, D., Zhu, G., Wang, H., Qian, S., Zhao, L., ... & Fanin, N. (2022). Earthworms exert long lasting afterlife effects on soil microbial communities. Geoderma, 420, 115906.

Maxwell, T. L., Fanin, N., Parker, W. C., Bakker, M. R., Belleau, A., Meredieu, C., ... & Munson, A. D. (2022). Tree species identity drives nutrient use efficiency in young mixed‐species plantations, at both high and low water availability. Functional Ecology, 36(8), 2069-2083.

Li, B., Li, Y., Fanin, N., Han, X., Du, X., Liu, H., ... & Li, Q. (2022). Adaptation of soil micro-food web to elemental limitation: evidence from the forest-steppe ecotone. Soil Biology and Biochemistry, 170, 108698.

Fanin, N., Mooshammer, M., Sauvadet, M., Meng, C., Alvarez, G., Bernard, L., ... & Nottingham, A. T. (2022). Soil enzymes in response to climate warming: Mechanisms and feedbacks. Functional ecology, 36(6), 1378-1395.

Bernard, L., Basile‐Doelsch, I., Derrien, D., Fanin, N., Fontaine, S., Guenet, B., ... & Maron, P. A. (2022). Advancing the mechanistic understanding of the priming effect on soil organic matter mineralisation. Functional Ecology, 36(6), 1355-1377.

Lembrechts, J. J., van den Hoogen, J., Aalto, J., Ashcroft, M. B., De Frenne, P., Kemppinen, J., …, Fanin, N., ... & Hik, D. S. (2022). Global maps of soil temperature. Global Change Biology, 28(9), 3110-3144.

Fanin, N., Lin, D., Freschet, G. T., Keiser, A. D., Augusto, L., Wardle, D. A., & Veen, G. F. (2021). Home‐field advantage of litter decomposition: from the phyllosphere to the soil. New Phytologist, 231(4), 1353-1358.

Youtube video summary on home field advantage

Fanin, N., Maxwell, T. L., Altinalmazis‐Kondylis, A., Bon, L., Meredieu, C., Jactel, H., ... & Augusto, L. (2022). Effects of mixing tree species and water availability on soil organic carbon stocks are depth dependent in a temperate podzol. European Journal of Soil Science, 73(1), e13133.

Graham, E. B., Averill, C., Bond-Lamberty, B., Knelman, J. E., Krause, S., Peralta, A. L., Fanin, N., & Contributor Consortium. (2021). Toward a generalizable framework of disturbance ecology through crowdsourced science. Frontiers in Ecology and Evolution, 9, 76.

Spitzer, C. M., Lindahl, B., Wardle, D. A., Sundqvist, M. K., Gundale, M. J., Fanin, N., & Kardol, P. (2021). Root trait–microbial relationships across tundra plant species. New Phytologist, 229(3), 1508-1520.

Altinalmazis-Kondylis, A., Muessig, K., Meredieu, C., Jactel, H., Augusto, L., Fanin, N., & Bakker, M. R. (2020). Effect of tree mixtures and water availability on belowground complementarity of fine roots of birch and pine planted on sandy podzol. Plant and Soil, 457(1), 437-455.

Lin, D., Yang, G., Dou, P., Qian, S., Zhao, L., Yang, Y., & Fanin, N. (2020). Microplastics negatively affect soil fauna but stimulate microbial activity: insights from a field-based microplastic addition experiment. Proceedings of the Royal Society B, 287(1934), 20201268.

Press communication on microplastics

Fanin, N., Alavoine, G., & Bertrand, I. (2020). Temporal dynamics of litter quality, soil properties and microbial strategies as main drivers of the priming effect. Geoderma, 377, 114576.

Maxwell, T. L., Augusto, L., Bon, L., Courbineau, A., Altinalmazis-Kondylis, A., Milin, S., ... & Fanin, N. (2020). Effect of a tree mixture and water availability on soil nutrients and extracellular enzyme activities along the soil profile in an experimental forest. Soil Biology and Biochemistry, 107864.

Lin, D., Dou, P., Yang, G., Qian, S., Wang, H., Zhao, L., ... & Fanin, N. (2020). Home‐field advantage of litter decomposition differs between leaves and fine roots. New Phytologist 227: 995–1000.

Fanin, N., Bezaud, S., Sarneel, J. M., Cecchini, S., Nicolas, M. & Augusto, L. (2019) Relative importance of climate, soil and plant functional traits during the early decomposition stage of standardized litter. Ecosystems, 23, 1004–1018.

Lin, D., Yang, S., Dou, P.,Wang, H., Wang, F., Qian, S., Yang, G., Zhao, L., Yang, Y. & Fanin, N. (2019). A plant economics spectrum of litter decomposition among coexisting fern species in a subtropical forest. Annals of botany 125, 145–155.

Wardle, D.A., Gundale, M. J., Kardol, P., Nilsson, M.C. & Fanin, N. (2019) Impact of plant functional group and species removals on soil and plant nitrogen and phosphorus across a retrogressive chronosequence.  Journal of ecology 108(2), 561-573.

Lin, D., Wang, F., Fanin, N., Pang, M., Dou, P., Wang, H., Qian, S., Zhao, L., Yang, Y., Mi, X. & Ma. K. (2019). Soil fauna promote litter decomposition but do not alter the relationship between leaf economics spectrum and litter decomposability. Soil Biology and Biochemistry 136, 107519.

Augusto, L., Fanin, N. & Bakker, M. R. (2019). When plants eat rocks: Functional adaptation of roots on rock outcrops.  Functional Ecology, 33 (5), 760-761.

Fanin, N., Kardol, P., Farrell, M., Kempel, A., Ciobanu, M., Nilsson, M.-C., Gundale, M. J. & Wardle, D.A. (2019). Effects of plant functional group removal on structure and function of soil communities across contrasting ecosystems. Ecology Letters, 22 (7)1095-1103.

Sauvadet, M., Fanin, N., Chauvat, M., & Bertrand, I. (2019). Can the comparison of above-and below-ground litter decomposition improve our understanding of bacterial and fungal successions? Soil Biology and Biochemistry 132, 24-27.

Fanin, N., Kardol, P., Farrell, M., Nilsson, M.-C., Gundale, M.J. & Wardle, D.A. (2019). The ratio of Gram-positive to Gram-negative bacterial PLFA markers as an indicator of carbon availability in organic soils. Soil Biology and Biochemistry 108, 111-114.

Lin, D., Pang, M., Fanin, N., Wang, H., Qian, S., Zhao, L. et al. (2019). Fungi participate in driving home-field advantage of litter decomposition in a subtropical forest. Plant and Soil 434, 467–480.

Kardol, P., Fanin, N. & Wardle D. (2018). Long-term effects of species loss on community properties across contrasting ecosystems. Nature 557, 710–713.

Press communication on biodiversity

Interview France Inter, La Science de l’environnement dans « La Tête au carré ».

Fanin, N., Gundale, M.J., Farrell, M., Ciobanu, M., Baldock, J.A., Nilsson, M.-C, Kardol, P. & Wardle D.A. (2018). Consistent effects of biodiversity loss on multifunctionality across contrasting ecosystems. Nature Ecology & Evolution 2, 269–278.

Press communication on multifunctionality