FANIN Nicolas

FANIN Nicolas

Chargé de Recherche

Chargé de Recherche

N_fanin

INRAE Centre de Bordeaux Aquitaine

 71 avenue E. Bourlaux, CS 20032 33882 Villenave d'Ornon cedex 

Tél : 05 57 12 25 16

nicolas.fanin@inrae.fr

 

Parcours

2017-Présent: Chargé de Recherche CR, Département EFPA –Ecologie des forêts, prairies et milieux aquatiques.

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2015-2016: Post-Doctorat, Department of Forest Ecology and Management, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU), Umeå-Suède. Rôle de la biodiversité sur les relations sol-plante et la multifonctionnalité des écosystèmes le long d’un gradient d’îles boréales.

2013-2014: Post-Doctorat, Fractionnement AgroRessources et Environnement (FARE), INRA, Reims-France. Rôle fonctionnel des communautés du sol lors de la minéralisation du carbone, de l’azote et du phosphore le long d’un gradient d’usage des terres.

2009-2012: Thèse de Doctorat, ‘Spécialité science du sol et fonctionnement des ecosystèmes’. Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), CNRS, Montpellier-France. Médaille d’argent de l’Académie d’Agriculture 2014. Influence de la qualité de la litière sur le fonctionnement microbien en forêt tropicale de Guyane française.

 

Recherches et compétences

Axes Nicolas Fanin

La ‘black box’ microbienne du sol est encore très largement inconnue en dépit du rôle central des microorganismes lors du recyclage de la matière organique et de la minéralisation des nutriments. En particulier, mes travaux de recherche visent à évaluer le rôle de la diversité fonctionnelle des sols lors des couplages entre cycles du carbone, azote et phosphore. Au cours de mes recherches, quatre axes principaux ont été identifiés comme étant des facteurs pouvant influencer la fonctionnalité des communautés microbiennes du sol : les effets de la diversité et de la qualité de la ressource d’origine minérale ou organique (Axe 1), de l’habitat et notamment des différent types de sols, d’usage des terres, ou du changement de conditions depuis la feuille verte vers le sol (Axe 2), des interactions biotiques et notamment des interactions avec la faune (Axe 3), et enfin des changements globaux et notamment des altération du climat, ou encore de l’invasion d’espèce ou de la pollution à différentes échelles spatiales (Axe 4). En retour, des modifications de la fonctionnalité des communautés microbiennes du sol peuvent altérer de nombreux processus biogéochimiques, qui elles-mêmes sous-tendent à la multifonctionnalité des écosystèmes terrestres. 

 

Projets en cours

•Projet VR (Swedish Research Council) - Context-dependency of biodiversity effects.

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En partenariat avec l’Université d’agriculture Suédoise à Uppsala et Umea et du CSIRO à Glen Osmond en Australie, j’aborde la question de savoir comment le contexte environnemental influence les effets de la biodiversité sur les processus écosystémiques. Pour ce faire nous utilisons un gradient de 30 îles (chacune étant un écosystème indépendant), représentent collectivement une chronoséquence d’îles boréales de plus de 5000 ans. Différentes espèces (myrtille, airelle…) et groupes fonctionnels de plantes (mousse, arbre, buisson…) ont été supprimés pendant plus de 20 ans afin de simuler une perte de biodiversité dans chacune de ces îles. L’objectif est d’identifier les mécanismes par lesquels la diversité des plantes influence la diversité du sol, et en retour, comprendre comment la perte de biodiversité influence la multifonctionnalité dans des écosystèmes contrastés.

 

•Projet Dipticc (Agence Nationale de la Recherche) - DIversité et Productivité des forêTs impactées par le Changement Climatique

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En partenariat avec Bordeaux Science Agro, BIOGECO (Bordeaux), l’EEF (Nancy) et le CEFE (Montpellier), l’objectif de ce projet est d’évaluer si la biodiversité des écosystèmes forestiers permet d’atténuer l’effet des changements climatiques. Pour ce faire, nous utilisons deux dispositifs: le dispositif ORPHEE dans lequel plus de 25000 arbres de 5 espèces locales ont été plantés dans toutes les conditions possibles ; le dispositif BIOPROFOR qui se compose de six sites naturels dans les Alpes dans lesquels les espèces sont étudiées à différents niveau d'élévation. L’objectif principal du projet est de tester si des peuplements plurispécifiques sont plus stables (résistant/résilient) face à la sécheresse que des peuplements monospécifiques. Plus particulièrement, nous étudions le fonctionnement du sol au travers des racines et champignons mycorhiziens et leurs impacts sur la disponibilité des nutriments au sein des écosystèmes forestiers.

 

•Projet TeaTime4Science (http://www.teatime4science.org/) - Can drinking tea help us understand climate change?

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L’objectif de ce projet participatif à large échelle et d’enterrer des sachets de thé vert et rouge, et de les récupérer trois mois plus tard afin mesurer les taux de décomposition. En partenariat avec l’ONF et le réseau RENECOFOR, plus de 1200 sachets de thé ont été disposés dans plus de 100 sites forestiers en France. Les résultats en lien aux données pédologiques des sols permettront de comprendre quels sont les principaux facteurs influençant le processus de décomposition. De plus, ces données rentreront dans une base de données mondiale permettant de mieux appréhender le rôle du climat lors du de la dégradation des matières organiques.

 

 

 

Enseignement et activités scientifiques

  • Bordeaux Sciences Agro: Science du sol, écologie microbienne. 
  • Université de Bordeaux (Master): Ecologie fonctionnelle, écologie du sol, écologie forestière.
  • Reviewer > 30 journals, associate editor in Frontiers in Forests & Global Change, section  Forest soils.

Publications

[69] Zhou J., Liu S., van Groenigen K. J., Mueller C. W., Ochoa-Hueso R., Fanin N., Ren Z., Zhang Y., Ma Y., Sun S., Hu J., Zhang Y., Yahdjian L., Wanek W., Olesen J. E., Kuzyakov Y., Liu J., Chen J. (2026). Contrasting responses of particulate and mineral-associated organic carbon stocks to grazing exclusion in an alpine meadow. Agriculture, Ecosystems & Environment 400:110227. https://doi.org/10.1016/j.agee.2026.110227

[68] Bon L., Fanin N., Bakker M. R., Bertrand I., Trichet P., Augusto L. (2026). Seasonal effects of soil microclimate on microbial activities depend on the understory in two forest ecosystems with contrasting water regimes. Geoderma 465:117672. https://doi.org/10.1016/j.geoderma.2025.117672

[67] Du L., Bol R., Tu C., Sun X., Luo R., Liu Q., Luo L., Zhan J., Yin C., Zhu B., Pang X., Fanin N. (2026). Micro‑Faunal and Edaphic Controls on Microbial Carbon Cycling Across Primary and Secondary Successional Trajectories. Global Change Biology 31:e70642. https://dx.doi.org/10.1111/gcb.70642

[66] Bourdin A., Augusto L., Joly F.-X., Bres C., Chahine T., Guillemot J., Hajek P., Jactel H., Jensen J., Mereu S., Muys B., Ponette Q., Sandén H., Parker W. C., Paquette A., Messier C., Robin A., Scherer-Lorenzen M., Serrano-León H., Weih M., Castagneyrol B., Bakker M. R., Fanin N. (2026). Context dependency of tree diversity effects on standardized substrates decomposition: Role of tree functional composition, mycorrhizal type and climatic conditions. Journal of Ecology, in press, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2745.70189, https://hal.inrae.fr/hal-05358193

[65] Song Z., Zuo X., Wang H., Wang Z., Zhang X., Hu Y., Hao F., Ma X., Fanin N. (2026). Contrasting impacts of grazing and shrub encroachment on microbial resource limitation in arid grasslands. Agriculture, Ecosystems & Environment, 396:110013. https://dx.doi.org/10.1016/j.agee.2025.110013, https://hal.inrae.fr/hal-05358195

[64] Kempel A., Adamidis G., Anadón J. D., Atkinson J., Auge H., Avtzis D., Bachelot B., Bashirzadeh M., Bota J. L., Classen A., Constantinou I., Crawley M., de Bellis T., Dostal P., Ebeling A., Eisenhauer N., Eldridge D. J., Encina G., Estrada C., Everingham S., Fanin N., Feng Y., Gaspar M., Gooriah L., Graff P., Gusmán Montalván E., Gusmán Montalván P., Hartke T. R., Huang L., Jochum M., Kaljund K., Karmiris I., Koorem K., Korell L., Laine A. L., Le Provost G., Lessard J. P., Liu M., Liu X., Liu Y., Llancabure J., Loïez S., Loydi A., Marrero H., Gockel S., Montoya A., Münzbergová Z., Niu Y., Ott D., Oyarzabal M., Panitsa M., Papatheodorou E., Piper F. I., Püssa K., Rand K., Saiz H., Sanders N. J., Schädler M., Scherber C., Semchenko M., Sepp S. K., Shah M. A., Shaheen I., Stein C., Stewart J., Tang Z., Tschan G., van Nouhuys S., Vandegehuchte M. L., Vernon M., V. R. S., Wang J., Xiao Y., Xystrakis F., Yang J., Yang S., Zografou K., Allan E. (2025). The Bug‐Network (BugNet): A global experimental network testing the effects of invertebrate herbivores and fungal pathogens on plant communities and ecosystem function in open ecosystems. Ecology and Evolution, 15 (10), https://dx.doi.org/10.1002/ece3.72111, https://hal.inrae.fr/hal-05325948

[63] van Galen L., Smith G. R., Margenot A. J., Waldrop M. P., Crowther T. W., Peay K. G., Jackson R. B., Yu K., Abrahão A., Ahmed T. A., Alatalo J. M., Anslan S., Anthony M. A., Araujo A. S. F., Ascher-Jenull J., Bach E. M., Bahram M., Baker C. C. M., Baldrian P., Bardgett R. D., Barrios-Garcia M. N., Bastida F., Beggi F., Benning L. G., Bragazza L., Broadbent A. A. D., Cano-Díaz C., Cates A. M., Cerri C. E. P., Cesarz S., Chen B., Classen A. T., Dahl M. B., Delgado-Baquerizo M., Eisenhauer N., Evgrafova S. Y., Fanin N., Fornasier F., Francisco R., Franco A. L. C., Frey S. D., Fritze H., García C., García-Palacios P., Gómez-Brandón M., Gonzalez-Polo M., Gozalo B., Griffiths R., Guerra C., Hallama M., Hiiesalu I., Hossain M. Z., Hu Y., Insam H., Jassey V. E. J., Jiang L., Kandeler E., Kohout P., Kõljalg U., Krashevska V., Li X., Lu J.-Z., Lu X., Luo S., Lutz S., Mackie-Haas K. A., Maestre F. T., Malmivaara-Lämsä M., Mangelsdorf K., Manjarrez M., Marhan S., Martin A., Mason K. E., Mayor J., McCulley R. L., Moora M., Morais P. V., Muñoz-Rojas M., Murugan R., Nottingham A. T., Ochoa V., Ochoa-Hueso R., Oja J., Olsson P. A., Öpik M., Ostle N., Peltoniemi K., Pennanen T., Pescador D. S., Png G. K., Poll C., Põlme S., Potapov A. M., Priemé A., Pritchard W., Puissant J., Rocha S. M. B., Rosinger C., Ruess L., Sayer E. J., Scheu S., Sinsabaugh R. L., Slaughter L. C., Soudzilovskaia N. A., Sousa J. P., Stanish L., Sugiyama S., Tedersoo L., Trivedi P., Vahter T., Voriskova J., Wagner D., Wang C., Wardle D. A., Whitaker J., Yang Y., Zhong Z., Zhu K., Ziolkowski L. A., Zobel M. & van den Hoogen J. (2025). A global database of soil microbial phospholipid fatty acids and enzyme activities. Scientific Data, 12 (1), 1568, https://dx.doi.org/10.1038/s41597-025-05759-2, https://hal.inrae.fr/hal-05293951

[62] Fanin N., Augusto L., Altinalmazis-Kondylis A., Bon L., Bourdin A., Hättenschwiler S., Martin-Blangy S., Maxwell T. L., Meredieu C., Morin X., Plat N., Toïgo M., Jactel H., Bakker M. R. (2025). Soil secrets and tree tales: An in-depth comparison of carbon storage in mixed and pure stands of pine and birch. Forest Ecology and Management, 592, 122827, https://dx.doi.org/10.1016/j.foreco.2025.122827, https://hal.inrae.fr/hal-05111798

[61] Sarneel J., Atkins J. W., Augusto L., Barel J. M., Duddigan S., Fanin N., Hefting M., Lembrechts J. J., Marín C., McDaniel M. D., Montagnani L., Parkhurst T., Petit Bon M., Sofo A., Keuskamp J. A. (2025). The Assumptions of the Tea Bag Index and Their Implications: A Reply to Mori 2025. Ecology Letters, 28 (4), e70117, https://dx.doi.org/10.1111/ele.70117, https://hal.inrae.fr/hal-05074860

[60] Fanin N., Asplund J., Gundale M., Kardol P., Nilsson M., Wardle D. (2025). Effects of boreal ground layer shrubs and bryophytes on the diversity, biomass and composition of lichen communities across contrasting ecosystems. Oikos, https://dx.doi.org/10.1002/oik.11099, https://hal.inrae.fr/hal-05034669

[59] Chen X., Cao J., Sinsabaugh R., Moorhead D., Bardgett R., Fanin N., Nottingham A., Zheng X., Chen J. (2025). Soil extracellular enzymes as drivers of soil carbon storage under nitrogen addition. Biological Reviews, https://dx.doi.org/10.1111/brv.70021, https://hal.inrae.fr/hal-05034707 

[58] Wang L., Liu Z., Bres C., Jin G., Fanin N. (2025). Exploring microbial ubiquity across different plant functional groups and organs. Plant and Soil, 1-17, https://dx.doi.org/10.1007/s11104-025-07356-z, https://hal.inrae.fr/hal-05178631

[57] Blondel P., Fanin N., Joubard B., Milin S., Rusch A., Giffard B. (2025). Organic matter content rather than farming practices modulates microbial activities in vineyard soils. Pedobiologia, 108, 151017, https://dx.doi.org/10.1016/j.pedobi.2024.151017, https://hal.inrae.fr/hal-05064995

[56] Wang L., Liu Z., Bres C., Jin G., Fanin N. (2024). Coniferous tree species identity and leaf aging alter the composition of phyllosphere communities through changes in leaf traits. Microbial ecology, 87 (1), 126, https://dx.doi.org/10.1007/s00248-024-02440-w, https://hal.inrae.fr/hal-05044451

[55] Dommanget F., Forey E., Chauvat M., Erktan A., Daniès L., Chesseron C., Fanin N. (2024). Asian knotweed’s impacts on soil chemistry and enzyme activities are higher in soils with low-nutrient status. Pedobiologia, 107, 151002, https://dx.doi.org/10.1016/j.pedobi.2024.151002, https://hal.inrae.fr/hal-04846629

[54] Sarneel J., Hefting M., Sandén T., van den Hoogen J., Routh D., Adhikari B., Alatalo J. M., Aleksanyan A., Althuizen I. H. J., Alsafran M. H. S. A., Atkins J. W., Augusto L., Aurela M., Azarov A. V., Barrio I. C., Beier C., Bejarano M. D., Benham S. E., Berg B., Bezler N. V., Björnsdóttir K., Bolinder M. A., Carbognani M., Cazzolla Gatti R., Chelli S., Chistotin M. V., Christiansen C. T., Courtois P., Crowther T. W., Dechoum M. S., Djukic I., Duddigan S., Egerton-Warburton L. M., Fanin N., Fantappiè M., Fares S., Fernandes G. W., Filippova N. V., Fliessbach A., Fuentes D., Godoy R., Grünwald T., Guzmán G., Hawes J. E., He Y., Hero J.-M., Hess L. L., Hogendoorn K., Høye T. T., Jans W. W. P., Jónsdóttir I. S., Keller S., Kepfer-Rojas S., Kuz'menko N. N., Larsen K. S., Laudon H., Lembrechts J. J., Li J., Limousin J.-M., Lukin S. M., Marques R., Marín C., McDaniel M. D., Meek Q., Merzlaya G. E., Michelsen A., Montagnani L., Mueller P., Murugan R., Myers-Smith I. H., Nolte S., Ochoa-Hueso R., Okafor B. N., Okorkov V. V., Onipchenko V. G., Orozco M. C., Parkhurst T., Peres C. A., Petit Bon M., Petraglia A., Pingel M., Rebmann C., Scheffers B. R., Schmidt I., Scholes M. C., Sheffer E., Shevtsova L. K., Smith S. W., Sofo A., Stevenson P. R., Strouhalová B., Sundsdal A., Sühs R. B., Tamene G., Thomas H. J. D., Tolunay D., Tomaselli M., Tresch S., Tucker D. L., Ulyshen M. D., Valdecantos A., Vandvik V., Vanguelova E. I., Verheyen K., Wang X., Yahdjian L., Yumashev X. S., Keuskamp J. A. (2024). Reading tea leaves worldwide: Decoupled drivers of initial litter decomposition mass‐loss rate and stabilization. Ecology Letters, 27 (5), https://dx.doi.org/10.1111/ele.14415, https://hal.inrae.fr/hal-04574740

[53] Khalfallah F., Bon L., El Mazlouzi M., Bakker M. R., Fanin N., Bellanger R., Bernier F., de Schrijver A., Ducatillon C., Fotelli M. N., Gateble G., Gundale M. J., Larsson M., Legout A., Mason W. L., Nordin A., Smolander A., Spyroglou G., Vanguelova E. I., Verheyen K., Vesterdal L., Zeller B., Augusto L., Derrien D., Buée M. (2024). “Ectomycorrhizal exploration type” could be a functional trait explaining the spatial distribution of tree symbiotic fungi as a function of forest humus forms. Mycorrhiza, https://dx.doi.org/10.1007/s00572-024-01146-8, https://hal.inrae.fr/hal-04592027

[52] Hu Z., Delgado-Baquerizo M., Fanin N., Chen X., Zhou Y., Du G., Hu F., Jiang L., Hu S., Liu M. (2024). Nutrient-induced acidification modulates soil biodiversity-function relationships. Nature Communications, 15, 2858, https://dx.doi.org/10.1038/s41467-024-47323-3, https://hal.inrae.fr/hal-04574829 

[51] Lin D., Shen R., Lin J., Zhu G., Yang Y., Fanin N. (2024). Relationships between rhizosphere microbial communities, soil abiotic properties and root trait variation within a pine species. Journal of Ecology, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2745.14297, https://hal.inrae.fr/hal-04540086

[50] Ouedraogo F., Cornu J.-Y., Fanin N., Janot N., Sourzac M., Parlanti E., Denaix L. (2024). Changes over time in organic matter dynamics and copper solubility in a vineyard soil after incorporation of cover crop residues: Insights from a batch experiment. Chemosphere, 350, 141137, https://dx.doi.org/10.1016/j.chemosphere.2024.141137, https://hal.inrae.fr/hal-04495783 

[49] Zhu M., Fanin N., Wang Q., Xu Z., Liang S., Ye J., Lin F., Yuan Z., Mao Z., Wang X., Hao Z. (2024). High functional breadth of microbial communities decreases home-field advantage of litter decomposition. Soil Biology and Biochemistry, 188, 109232, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2023.109232, https://hal.inrae.fr/hal-04503312

[48] Dommanget F., François A., Chauvat M., Forey E., Erktan A., Fanin N., Chesseron C., Albert A. (2023). Renouées asiatiques envahissantes : la restauration de berges par le génie végétal est-elle si bénéfique à la qualité chimique et à la biodiversité du sol? Sciences Eaux & Territoires, (43), 87-93, https://dx.doi.org/10.20870/Revue-SET.2023.43.7627, https://hal.inrae.fr/hal-04281597

[47] Hou J., Fanin N., Ni Z. (2023). A network prediction model to quantify relationship between biodiversity and ecosystem functioning (BEF). Methods in Ecology and Evolution, 14 (12), 2907-2916, https://dx.doi.org/10.1111/2041-210X.14245, https://hal.inrae.fr/hal-04574928 

[46] Li B., Li Y., Fanin N., Veen G., Han X., Du X., Li Y., Sun Y., Li Q. (2023). Stoichiometric imbalances between soil microorganisms and their resources regulate litter decomposition. Functional Ecology, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.14459, https://hal.inrae.fr/hal-04286738

[45] Bourget M., Fanin N., Fromin N., Hättenschwiler S., Roumet C., Shihan A., Huys R., Sauvadet M., Freschet G. (2023). Plant litter chemistry drives long‐lasting changes in the catabolic capacities of soil microbial communities. Functional Ecology, 37, 2014-2028, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.14379, https://hal.inrae.fr/hal-04122640 

[44] Maxwell T., Augusto L., Tian Y., Wanek W., Fanin N. (2023). Water availability is a stronger driver of soil microbial processing of organic nitrogen than tree species composition. European Journal of Soil Science, 74 (1), https://dx.doi.org/10.1111/ejss.13350, https://hal.inrae.fr/hal-04098843 

[43] Bon L., Augusto L., Gaudry J., Bakker M., Lambrot C., Milin S., Trichet P., Fanin N. (2023). Effects of fertilisation and understory removal on aboveground and belowground carbon stocks in wet and dry moorlands in south-western France. European Journal of Forest Research, 142 (4), 723-737, https://dx.doi.org/10.1007/s10342-023-01551-2, https://hal.inrae.fr/hal-04160207 

[42] Lin J., Lin D., Zhu G., Wang H., Qian S., Zhao L., Yang Y., Fanin N. (2022). Earthworms exert long lasting afterlife effects on soil microbial communities. Geoderma, 420, 115906, https://dx.doi.org/10.1016/j.geoderma.2022.115906, https://hal.inrae.fr/hal-04029917

[41] Fanin N., Clemmensen K., Lindahl B., Farrell M., Nilsson M., Gundale M., Kardol P., Wardle D. (2022). Ericoid shrubs shape fungal communities and suppress organic matter decomposition in boreal forests. New Phytologist, 1-14, https://dx.doi.org/10.1111/nph.18353, https://hal.inrae.fr/hal-03745377 

[40] Maxwell T., Fanin N., Parker W., Bakker M., Belleau A., Meredieu C., Augusto L., Munson A. (2022). Tree species identity drives nutrient use efficiency in young mixed‐species plantations, at both high and low water availability. Functional Ecology, 36 (8), 2069 - 2083, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.14109, https://hal.inrae.fr/hal-03745508 

[39] Bernard L., Basile-Doelsch I., Derrien D., Fanin N., Fontaine S., Guenet B., Karimi B., Maron P. (2022). Le Priming Effect dans le sol: mécanismes, acteurs et conséquences sur les services écosystémiques dans un contexte de changement global. Étude et Gestion des Sols, 29, 239-274, https://hal.inrae.fr/hal-03685054 

[38] Li B., Li Y., Fanin N., Han X., Du X., Liu H., Li Y., Li Q. (2022). Adaptation of soil micro-food web to elemental limitation: evidence from the forest-steppe ecotone. Soil Biology and Biochemistry, 170, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2022.108698, https://hal.inrae.fr/hal-03750308

[37] Bernard L., Basile-Doelsch I., Derrien D., Fanin N., Fontaine S., Guenet B., Karimi B., Marsden C., Maron P. (2022). Advancing the mechanistic understanding of the priming effect on soil organic matter mineralisation. Functional Ecology, 36 (6), 1355-1377, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.14038, https://hal.inrae.fr/hal-03639598 

[36] Fanin N., Mooshammer M., Sauvadet M., Meng C., Alvarez G., Bernard L., Bertrand I., Blagodatskaya E., Bon L., Fontaine S., Niu S., Lashermes G., Maxwell T. L., Weintraub M. N., Wingate L., Moorhead D., Nottingham A. T. (2022). Soil enzymes in response to climate warming: mechanisms and feedbacks. Functional Ecology, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.14027, https://hal.inrae.fr/hal-03590923

[35] Maillard F., Jusino M., Andrews E., Moran M., Vaziri G., Banik M., Fanin N., Trettin C., Lindner D., Schilling J. (2022). Wood-decay type and fungal guild dominance across a North American log transplant experiment. Fungal Ecology, 59, 101151, https://dx.doi.org/10.1016/j.funeco.2022.101151, https://hal.inrae.fr/hal-03845610 

[34] Spitzer C., Lindahl B., Wardle D., Sundqvist M., Gundale M., Fanin N., Kardol P. (2021). Root trait-microbial relationships across tundra plant species. New Phytologist, 229 (3), 1508-1520, https://dx.doi.org/10.1111/nph.16982, https://hal.inrae.fr/hal-03006806 

[33] Fanin N., Lin D., Freschet G., Keiser A., Augusto L., Wardle D., Veen G. (2021). Home-field advantage of litter decomposition: from the phyllosphere to the soil. New Phytologist, 231 (4), 1353-1358, https://dx.doi.org/10.1111/nph.17475, https://hal.inrae.fr/hal-03267667 

[32] Fanin N., Maxwell T., Altinalmazis‐Kondylis A., Bon L., Meredieu C., Jactel H., Bakker M., Augusto L. (2022). Effects of mixing tree species and water availability on soil organic carbon stocks are depth dependent in a temperate podzol. European Journal of Soil Science, 73 (1), e13133, https://dx.doi.org/10.1111/ejss.13133, https://hal.inrae.fr/hal-03256070

[31] [31] Lembrechts J., van den Hoogen J., Aalto J., Ashcroft M. B., De Frenne P., Kemppinen J., Kopecký M., Luoto M., Maclean I. M. D., Crowther T. W., Bailey J. J., Haesen S., Klinges D. H., Niittynen P., Scheffers B. R., Van Meerbeek K., Aartsma P., Abdalaze O., Abedi M., Aerts R., Ahmadian N., Ahrends A., Alatalo J. M., Alexander J. M., Allonsius C. N., Altman J., Ammann C., Andres C., Andrews C., Ardö J., Arriga N., Arzac A., Aschero V., Assis R. L., Assmann J. J., Bader M. Y., Bahalkeh K., Barančok P., Barrio I. C., Barros A., Barthel M., Basham E. W., Bauters M., Bazzichetto M., Belelli Marchesini L., Bell M. C., Benavides J. C., Benito Alonso J. L., Berauer B. J., Bjerke J. W., Björk R. G., Björkman M. P., Björnsdóttir K., Blonder B., Boeckx P., Boike J., Bokhorst S., Brum B. N. S., Brůna J., Buchmann N., Buysse P., Camargo J. L., Campoe O. C., Candan O., Canessa R., Cannone N., Carbognani M., Carnicer J., Casanova-Katny A., Cesarz S., Chojnicki B., Choler P., Chown S. L., Cifuentes E. F., Čiliak M., Contador T., Convey P., Cooper E. J., Cremonese E., Curasi S. R., Curtis R., Cutini M., Dahlberg C. J., Daskalova G. N., de Pablo M. A., Della Chiesa S., Dengler J., Deronde B., Descombes P., Di Cecco V., Di Musciano M., Dick J., Dimarco R. D., Dolezal J., Dorrepaal E., Dušek J., Eisenhauer N., Eklundh L., Erickson T. E., Erschbamer B., Eugster W., Ewers R. M., Exton D. A., Fanin N., Fazlioglu F., Feigenwinter I., Fenu G., Ferlian O., Fernández Calzado M. R., Fernández-Pascual E., Finckh M., Finger Higgens R., Forte T. G. W., Freeman E. C., Frei E. R., Fuentes-Lillo E., García R. A., García M. B., Géron C., Gharun M., Ghosn D., Gigauri K., Gobin A., Goded I., Goeckede M., Gottschall F., Goulding K., Govaert S., Graae B. J., Greenwood S., Greiser C., Grelle A., Guénard B., Guglielmin M., Guillemot J., Haase P., Haider S., Halbritter A. H., Hamid M., Hammerle A., Hampe A., Haugum S. V., Hederová L., Heinesch B., Helfter C., Hepenstrick D., Herberich M., Herbst M., Hermanutz L., Hik D. S., Hoffrén R., Homeier J., Hörtnagl L., Høye T. T., Hrbacek F., Hylander K., Iwata H., Jackowicz-Korczynski M. A., Jactel H., Järveoja J., Jastrzębowski S., Jentsch A., Jiménez J. J., Jónsdóttir I. S., Jucker T., Jump A. S., Juszczak R., Kanka R., Kašpar V., Kazakis G., Kelly J., Khuroo A. A., Klemedtsson L., Klisz M., Kljun N., Knohl A., Kobler J., Kollár J., Kotowska M. M., Kovács B., Kreyling J., Lamprecht A., Lang S. I., Larson C., Larson K., Laska K., le Maire G., Leihy R. I., Lens L., Liljebladh B., Lohila A., Lorite J., Loubet B., Lynn J., Macek M., Mackenzie R., Magliulo E., Maier R., Malfasi F., Máliš F., Man M., Manca G., Manco A., Manise T., Manolaki P., Marciniak F., Matula R., Mazzolari A. C., Medinets S., Medinets V., Meeussen C., Merinero S., Mesquita R. C. G., Meusburger K., Meysman F. J. R., Michaletz S. T., Milbau A., Moiseev D., Moiseev P., Mondoni A., Monfries R., Montagnani L., Moriana-Armendariz M., Morra di Cella U., Mörsdorf M., Mosedale J. R., Muffler L., Muñoz-Rojas M., Myers J. A., Myers-Smith I. H., Nagy L., Nardino M., Naujokaitis-Lewis I., Newling E., Nicklas L., Niedrist G., Niessner A., Nilsson M. B., Normand S., Nosetto M. D., Nouvellon Y., Nuñez M. A., Ogaya R., Ogée J., Okello J., Olejnik J., Olesen J. E., Opedal Ø. H., Orsenigo S., Palaj A., Pampuch T., Panov A. V., Pärtel M., Pastor A., Pauchard A., Pauli H., Pavelka M., Pearse W. D., Peichl M., Pellissier L., Penczykowski R. M., Penuelas J., Petit Bon M., Petraglia A., Phartyal S. S., Phoenix G. K., Pio C., Pitacco A., Pitteloud C., Plichta R., Porro F., Portillo-Estrada M., Poulenard J., Poyatos R., Prokushkin A. S., Puchalka R., Pușcaș M., Radujković D., Randall K., Ratier Backes A., Remmele S., Remmers W., Renault D., Risch A. C., Rixen C., Robinson S. A., Robroek B. J. M., Rocha A. V., Rossi C., Rossi G., Roupsard O., Rubtsov A. V., Saccone P., Sagot C., Sallo Bravo J., Santos C. C., Sarneel J. M., Scharnweber T., Schmeddes J., Schmidt M., Scholten T., Schuchardt M., Schwartz N., Scott T., Seeber J., Segalin de Andrade A. C., Seipel T., Semenchuk P., Senior R. A., Serra-Diaz J. M., Sewerniak P., Shekhar A., Sidenko N. V., Siebicke L., Siegwart Collier L., Simpson E., Siqueira D. P., Sitková Z., Six J., Smiljanic M., Smith S. W., Smith-Tripp S., Somers B., Sørensen M. V., Souza J. J. L. L., Souza B. I., Souza Dias A., Spasojevic M. J., Speed J. D. M., Spicher F., Stanisci A., Steinbauer K., Steinbrecher R., Steinwandter M., Stemkovski M., Stephan J. G., Stiegler C., Stoll S., Svátek M., Svoboda M., Tagesson T., Tanentzap A. J., Tanneberger F., Theurillat J.-P., Thomas H. J. D., Thomas A. D., Tielbörger K., Tomaselli M., Treier U. A., Trouillier M., Turtureanu P. D., Tutton R., Tyystjärvi V. A., Ueyama M., Ujházy K., Ujházyová M., Uogintas D., Urban A. V., Urban J., Urbaniak M., Ursu T.-M., Vaccari F. P., Van de Vondel S., van den Brink L., Van Geel M., Vandvik V., Vangansbeke P., Varlagin A., Veen G. F., Veenendaal E., Venn S. E., Verbeeck H., Verbrugggen E., Verheijen F. G. A., Villar L., Vitale L., Vittoz P., Vives-Ingla M., von Oppen J., Walz J., Wang R., Wang Y., Way R. G., Wedegärtner R. E. M., Weigel R., Wild J., Wilkinson M., Wilmking M., Wingate L., Winkler M., Wipf S., Wohlfahrt G., Xenakis G., Yang Y., Yu Z., Yu K., Zellweger F., Zhang J., Zhang Z., Zhao P., Ziemblińska K., Zimmermann R., Zong S., Zyryanov V. I., Nijs I., Lenoir J. (2022). Global maps of soil temperature. Global Change Biology, 28 (9), 3110-3144, https://dx.doi.org/10.1111/gcb.16060, https://hal.inrae.fr/hal-03518443 

[30] Altinalmazis-Kondylis A., Muessig K., Meredieu C., Jactel H., Augusto L., Fanin N., Bakker M. (2020). Effect of tree mixtures and water availability on belowground complementarity of fine roots of birch and pine planted on sandy podzol. Plant and Soil, 457, 437-455, https://dx.doi.org/10.1007/s11104-020-04741-8, https://hal.inrae.fr/hal-03093791 

[29] Spitzer C., Wardle D., Lindahl B., Sundqvist M., Gundale M., Fanin N., Kardol P. (2021). Root traits and soil micro‐organisms as drivers of plant-soil feedbacks within the sub‐arctic tundra meadow. Journal of Ecology, 1-13, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2745.13814, https://hal.inrae.fr/hal-03464328 

[28] Lin D., Yang G., Dou P., Qian S., Zhao L., Yang Y., Fanin N. (2020). Microplastics negatively affect soil fauna but stimulate microbial activity: insights from a field-based microplastic addition experiment. Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 287 (1934), 1-9, https://dx.doi.org/10.1098/rspb.2020.1268, https://hal.inrae.fr/hal-03173558 

[27] Fanin N., Bezaud S., Sarneel J., Cecchini S., Nicolas M., Augusto L. (2020). Relative Importance of Climate, Soil and Plant Functional Traits During the Early Decomposition Stage of Standardized Litter. Ecosystems, 23 (5), 1004-1018, https://dx.doi.org/10.1007/s10021-019-00452-z, https://hal.inrae.fr/hal-04642793 

[26] Fanin N., Alavoine G., Bertrand I. (2020). Temporal dynamics of litter quality, soil properties and microbial strategies as main drivers of the priming effect. Geoderma, 377, 114576, https://dx.doi.org/10.1016/j.geoderma.2020.114576, https://hal.inrae.fr/hal-02911746

[25] Maxwell T., Augusto L., Bon L., Courbineau A., Altinalmazis-Kondylis A., Milin S., Bakker M., Jactel H., Fanin N. (2020). Effect of a tree mixture and water availability on soil nutrients and extracellular enzyme activities along the soil profile in an experimental forest. Soil Biology and Biochemistry, 148, 1-11, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2020.107864, https://hal.inrae.fr/hal-02947095 

[24] Lin D., Dou P., Yang G., Qian S., Wang H., Zhao L., Yang Y., Mi X., Ma K., Fanin N. (2020). Home‐field advantage of litter decomposition differs between leaves and fine roots. New Phytologist, 227 (4), 995-1000, https://dx.doi.org/10.1111/nph.16517, https://hal.inrae.fr/hal-03345983 

[23] Graham E. B., Averill C., Bond-Lamberty B., Knelman J. E., Krause S., Peralta A. L., Shade A., Smith A. P., Cheng S. J., Fanin N., Freund C., Garcia P. E., Gibbons S. M., Van Goethem M. W., Ben Guebila M., Kemppinen J., Nowicki R. J., Pausas J. G., Reed S. P., Rocca J., Sengupta A., Sihi D., Simonin M., Słowiński M., Spawn S. A., Sutherland I., Tonkin J. D., Wisnoski N. I., Zipper S. C., Contributor Consortium (2021-03-03). Toward a generalizable framework of disturbance ecology through crowdsourced science. Frontiers in Ecology and Evolution, 9, https://dx.doi.org/10.3389/fevo.2021.588940, https://hal.inrae.fr/hal-03220658 

[22] Lin D., Yang S., Dou P., Wang H., Wang F., Qian S., Yang G., Zhao L., Yang Y., Fanin N. (2020). A plant economics spectrum of litter decomposition among coexisting fern species in a sub-tropical forest. Annals of Botany, 125 (1), 1-11, https://dx.doi.org/10.1093/aob/mcz166, https://hal.inrae.fr/hal-02620344 

[21] Wardle D., Gundale M., Kardol P., Nilsson M., Fanin N. (2020). Impact of plant functional group and species removals on soil and plant nitrogen and phosphorus across a retrogressive chronosequence. Journal of Ecology, 108 (2), 561-573, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2745.13283, https://hal.inrae.fr/hal-02527321 

[20] Lin D., Wang F., Fanin N., Pang M., Dou P., Wang H., Qian S., Zhao L., Yang Y., Mi X., Ma K. (2019). Soil fauna promote litter decomposition but do not alter the relationship between leaf economics spectrum and litter decomposability. Soil Biology and Biochemistry, 136, 1-8, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2019.107519, https://hal.inrae.fr/hal-02171446

[19] Augusto L., Fanin N., Bakker M. R. (2019). When plants eat rocks: Functional adaptation of roots on rock outcrops. Functional Ecology, 33 (5), 760-761, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.13325, https://hal.inrae.fr/hal-02623798 

[18] Sauvadet M., Fanin N., Chauvat M., Bertrand I. (2019). Can the comparison of above- and below-ground litter decomposition improve our understanding of bacterial and fungal successions? Soil Biology and Biochemistry, 132, 24-27, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2019.01.022, https://hal.inrae.fr/hal-02321811 

[17] Fanin N., Kardol P., Farrell M., Kempel A., Ciobanu M., Nilsson M., Gundale M. J., Wardle D. A. (2019). Effects of plant functional group removal on structure and function of soil communities across contrasting ecosystems. Ecology Letters, 22 (7), 1095-1103, https://dx.doi.org/10.1111/ele.13266, https://hal.inrae.fr/hal-02629183

[16] Lin D., Pang M., Fanin N., Wang H., Qian S., Zhao L., Yang Y., Mi X., Ma K. (2019). Fungi participate in driving home-field advantage of litter decomposition in a subtropical forest. Plant and Soil, 434 (1-2), 467-480, https://dx.doi.org/10.1007/s11104-018-3865-5, https://hal.inrae.fr/hal-02627353

[15] Fanin N., Kardol P., Farrell M., Nilsson M.-C., Gundale M. J., Wardle D. A. (2019). The ratio of Gram-positive to Gram-negative bacterial PLFA markers as an indicator of carbon availability in organic soils. Soil Biology and Biochemistry, 128, 111-114, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2018.10.010, https://hal.inrae.fr/hal-02624611 

[14] Kardol P., Fanin N., Wardle D. A. (2018). Long-term effects of species loss on community properties across contrasting ecosystems. Nature, 557 (7707), 710-713, https://dx.doi.org/10.1038/s41586-018-0138-7, https://hal.inrae.fr/hal-02626980 

Press communication on biodiversity

Interview France Inter, La Science de l’environnement dans « La Tête au carré ».

[13] Fanin N., Gundale M. J., Farrell M., Ciobanu M., Baldock J. A., Nilsson M.-C., Kardol P., Wardle D. A. (2018). Consistent effects of biodiversity loss on multifunctionality across contrasting ecosystems. Nature Ecology & Evolution, 2 (2), 269-278, https://dx.doi.org/10.1038/s41559-017-0415-0, https://hal.inrae.fr/hal-02621923 

Press communication on multifunctionality

[12] Fanin N., Fromin N., Barantal S., Hättenschwiler S. (2017). Stoichiometric plasticity of microbial communities is similar between litter and soil in a tropical rainforest. Scientific Reports, 7 (1), 1-7, https://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-12609-8, https://hal.inrae.fr/hal-02127308

[11] Schneider A. R., Gommeaux M., Duclercq J., Fanin N., Conreux A., Alahmad A., Lacoux J., Roger D., Spicher F., Ponthieu M., Cancès B., Morvan X., Marin B. (2017). Response of bacterial communities to Pb smelter pollution in contrasting soils. Science of the Total Environment, 605-606, 436-444, https://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2017.06.159, https://hal.inrae.fr/hal-01604416

[10] Fanin N., Moorhead D., Bertrand I. (2016). Eco-enzymatic stoichiometry and enzymatic vectors reveal differential C, N, P dynamics in decaying litter along a land-use gradient. Biogeochemistry, 129, 21-36, https://dx.doi.org/10.1007/s10533-016-0217-5, https://hal.inrae.fr/hal-02637317

[9] Sauvadet M., Chauvat M., Fanin N., Coulibaly S., Bertrand I. (2016). Comparing the effects of litter quantity and quality on soil biota structure and functioning: Application to a cultivated soil in Northern France. Applied Soil Ecology, 107, 261-271, https://dx.doi.org/10.1016/j.apsoil.2016.06.010, https://hal.inrae.fr/hal-02633738 

[8] Fanin N., Bertrand I. (2016). Aboveground litter quality is a better predictor than belowground microbial communities when estimating carbon mineralization along a land-use gradient. Soil Biology and Biochemistry, 94, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2015.11.007, https://hal.inrae.fr/hal-01269407

[7] Fanin N., Hättenschwiler S., Chavez Soria P. F., Fromin N. (2016). (A)synchronous availabilities of N and P regulate the activity and structure of the microbial decomposer community. Frontiers in Microbiology, 6, 1-13, https://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2015.01507, https://hal.inrae.fr/hal-01604732 

[6] Fanin N., Fromin N., Bertrand I. (2016). Functional breadth and home-field advantage generate functional differences among soil microbial decomposers. Ecology, 97 (4), https://dx.doi.org/10.1890/15-1263.1, https://hal.inrae.fr/hal-01269374

[5] Fanin N., Hättenschwiler S., Schimann H., Fromin N. (2015). Interactive effects of C, N and P fertilization on soil microbial community structure and function in an Amazonian rain forest. Functional Ecology, 29 (1), 140-150, https://dx.doi.org/10.1111/1365-2435.12329, https://hal.inrae.fr/hal-02127024 

[4] Fanin N., Hättenschwiler S., Fromin N. (2014). Litter fingerprint on microbial biomass, activity, and community structure in the underlying soil. Plant and Soil, 379 (1-2), 79-91, https://dx.doi.org/10.1007/s11104-014-2051-7, https://hal.inrae.fr/hal-01605484

[3] Fanin N., Fromin N., Buatois B., Hättenschwiler S. (2013). An experimental test of the hypothesis of non-homeostatic consumer stoichiometry in a plant litter-microbe system. Ecology Letters, 16 (6), 764-772, https://dx.doi.org/10.1111/ele.12108, https://hal.inrae.fr/hal-01604136

[2] Fanin N., Barantal S., Fromin N., Schimann H., Schevin P., Hättenschwiler S. (2012). Distinct microbial limitations in litter and underlying soil revealed by carbon and nutrient fertilization in a tropical rainforest. PLoS ONE, 7 (12), 1-11, https://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0049990, https://hal.inrae.fr/hal-01601804 

[1] Fanin N., Hättenschwiler S., Barantal S., Schimann H., Fromin N. (2011). Does variability in litter quality determine soil microbial respiration in an amazonian rainforest? Soil Biology and Biochemistry, 43 (5), 1014-1022, https://dx.doi.org/10.1016/j.soilbio.2011.01.018, https://hal.inrae.fr/hal-01032139

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